{"id":411,"date":"2021-01-26T22:50:03","date_gmt":"2021-01-26T22:50:03","guid":{"rendered":"http:\/\/alexsanderluizqueirozsilva.com.br\/?p=411"},"modified":"2021-01-26T22:50:10","modified_gmt":"2021-01-26T22:50:10","slug":"variante-do-coronavirus-por-que-o-japao-descobriu-antes-do-brasil-a-linhagem-do-virus-vinda-de-manaus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/alexsanderluizqueirozsilva.com.br\/index.php\/variante-do-coronavirus-por-que-o-japao-descobriu-antes-do-brasil-a-linhagem-do-virus-vinda-de-manaus\/","title":{"rendered":"Variante do coronav\u00edrus: por que o Jap\u00e3o descobriu antes do Brasil a linhagem do v\u00edrus vinda de Manaus"},"content":{"rendered":"\n

26\/01\/2021<\/p>\n\n\n\n

No dia 10 de janeiro de 2021, o Jap\u00e3o notificou o Brasil de que quatro viajantes com sintomas de covid-19 que desembarcaram em T\u00f3quio vindos do Amazonas estavam infectados com uma nova variante do Sars-CoV-2.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Segundo as autoridades sanit\u00e1rias japonesas, a nova cepa continha 12 muta\u00e7\u00f5es, entre elas uma altera\u00e7\u00e3o na prote\u00edna que permite a entrada do v\u00edrus nas c\u00e9lulas humanas \u2014 e que foi observada em novas linhagens identificadas no Reino Unido e na \u00c1frica do Sul possivelmente mais contagiosas.<\/p>\n\n\n\n

O Brasil sequenciou em tempo recorde o primeiro genoma do coronav\u00edrus que circulava no pa\u00eds \u2014 cerca de 48 horas ap\u00f3s a confirma\u00e7\u00e3o do primeiro caso, em 26 de fevereiro.<\/p>\n\n\n\n

Quase um ano depois, o pa\u00eds tem estrutura e pessoal qualificado, dizem os cientistas, mas n\u00e3o possui recursos para fazer uma vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica que acompanhe em tempo real as muta\u00e7\u00f5es do v\u00edrus.<\/p>\n\n\n\n

O virologista Felipe Naveca, pesquisador do Instituto Le\u00f4nidas & Maria Deane (ILMD\/Fiocruz Amaz\u00f4nia), refer\u00eancia na an\u00e1lise gen\u00f4mica no Amazonas, onde foi identificada a variante que tem preocupado especialistas, afirma que n\u00e3o existe uma rotina di\u00e1ria de sequenciamento gen\u00e9tico na regi\u00e3o.<\/p>\n\n\n\n

“Para fazer isso ter\u00edamos que ter uma equipe dedicada s\u00f3 ao sequenciamento, com automa\u00e7\u00e3o e investimentos muito maiores do que h\u00e1 hoje”, diz ele.<\/p>\n\n\n\n

“Caso contr\u00e1rio, todo o recurso acabaria em 3 meses, quando a nossa proposta \u00e9 sequenciar durante o maior tempo poss\u00edvel e mostrar as mudan\u00e7as ao longo desse tempo.”<\/p>\n\n\n\n

Em paralelo ao processamento de diagn\u00f3sticos de testes de PCR, tamb\u00e9m feito no instituto, a equipe sequencia 96 genomas de alta qualidade a cada duas ou tr\u00eas semanas.<\/p>\n\n\n\n

A \u00c1frica do Sul, que tem cerca de um quarto da popula\u00e7\u00e3o brasileira e tem sido considerado um exemplo bem sucedido de vigil\u00e2ncia, sequencia entre 50 e 100 genomas de coronav\u00edrus por semana.<\/p>\n\n\n\n

O Reino Unido faz cerca de 10 mil sequenciamentos por semana e se prepara para dobrar esse n\u00famero nos pr\u00f3ximos meses. O pa\u00eds tem de longe a maior capacidade de processamento, respondendo por cerca de 200 mil entre os 400 mil genomas compartilhados por cientistas de todo o mundo na\u00a0plataforma Gisaid<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Concorr\u00eancia entre sequenciamento e exames de PCR<\/h2>\n\n\n\n

N\u00e3o existem dados consolidados sobre o volume sequenciado por semana no pa\u00eds ou a capacidade de processamento.<\/p>\n\n\n\n

Existem algumas iniciativas que caminham em paralelo \u2014 uma delas \u00e9 a rede gen\u00f4mica da Fiocruz<\/a>, que conta com institui\u00e7\u00f5es em 11 Estados e analisa amostras de todo o pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

A chefe do Laborat\u00f3rio de V\u00edrus Respirat\u00f3rios e Sarampo do Instituto Oswaldo Cruz (IOC\/Fiocruz), Marilda Siqueira, que atua como Centro de Refer\u00eancia Nacional em v\u00edrus respirat\u00f3rios junto ao Minist\u00e9rio da Sa\u00fade, afirma que os laborat\u00f3rios da rede t\u00eam realizado sequenciamentos desde o in\u00edcio da pandemia \u2014 uma expertise que vem em parte da vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica do v\u00edrus influenza feita h\u00e1 anos pelo grupo.<\/p>\n\n\n\n

Dada a gravidade da pandemia no pa\u00eds, entretanto, o trabalho tem muitas vezes de ser dividido com o processamento de exames diagn\u00f3sticos de PCR – por isso o volume de an\u00e1lises gen\u00f4micas \u00e9 inferior ao que as equipes desejariam.<\/p>\n\n\n\n

Ainda assim, ressalta Marilda, o Brasil responde por cerca de 2,4 mil dos 5 mil genomas do Sars-CoV-2 cadastrados pela Am\u00e9rica do Sul na plataforma Gisaid.<\/p>\n\n\n\n

“A gente n\u00e3o est\u00e1 t\u00e3o ruim assim quando se pensa em regi\u00e3o. Temos, claro, que melhorar, e estamos buscando essa melhora.”<\/p>\n\n\n\n

O esfor\u00e7o agora, diz ela, \u00e9 para que a vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica do coronav\u00edrus seja em tempo real, para que o pa\u00eds conhe\u00e7a as variantes que circulam no territ\u00f3rio de forma mais r\u00e1pida e os gestores de sa\u00fade possam “se antecipar” para tentar controlar, por exemplo, a dissemina\u00e7\u00e3o de linhagens que sejam mais transmiss\u00edveis.<\/p>\n\n\n\n

Para isso, \u00e9 preciso aumentar o n\u00famero de amostras sequenciadas e estruturar uma log\u00edstica que garanta a an\u00e1lise sistem\u00e1tica de dados de toda as regi\u00f5es do pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

A linhagem descoberta em Manaus, que tem preocupado cientistas em todo o mundo, tornou esse avan\u00e7o ainda mais premente, mas o esfor\u00e7o para tentar ampliar a an\u00e1lise gen\u00f4mica das amostras do pa\u00eds \u00e9 anterior, diz a pesquisadora.<\/p>\n\n\n\n

Reagentes cotados em d\u00f3lar<\/h2>\n\n\n\n

Em outra frente, o Brasil conta com a ajuda de um dos 300 supercomputadores mais potentes do mundo \u2014 o SDumont, que fica no Laborat\u00f3rio Nacional de Computa\u00e7\u00e3o Cient\u00edfica (LNCC), em Petr\u00f3polis (RJ).<\/p>\n\n\n\n

L\u00e1, a pesquisadora Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos, respons\u00e1vel pelo Laborat\u00f3rio de Bioinform\u00e1tica do LNCC, e sua equipe de 25 pesquisadores fazem o sequenciamento de amostras do Rio de Janeiro e de outras regi\u00f5es do pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

Do in\u00edcio da pandemia at\u00e9 o momento, foram feitos cerca de 400 sequenciamentos, um n\u00famero bem abaixo do que a cientista gostaria.<\/p>\n\n\n\n

O principal gargalo, diz ela, \u00e9 verba.<\/p>\n\n\n\n

“Estrutura f\u00edsica o Brasil tem, pessoal qualificado, tamb\u00e9m \u2014 trabalhamos em rede gen\u00f4mica h\u00e1 20, 30 anos”, afirma. “A gente precisa de mais recursos para custeio, para comprar reagentes e ter acesso \u00e0s amostras das diferentes regi\u00f5es do pa\u00eds.”<\/p>\n\n\n\n

Os reagentes usados no processo de sequenciamento s\u00e3o importados \u2014 e passaram a custar bem mais com a desvaloriza\u00e7\u00e3o do real nos \u00faltimos meses.<\/p>\n\n\n\n

Antes disso, entretanto, a vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica j\u00e1 havia sido impactada pelos cortes sucessivos que o or\u00e7amento da Ci\u00eancia e Tecnologia vem sofrendo no pa\u00eds pelo menos desde 2016.<\/p>\n\n\n\n

“E vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica \u00e9 algo que tem de ser constante, a ideia \u00e9 antever o que vai acontecer”, pontua Ana Tereza.<\/p>\n\n\n\n

A burocracia brasileira para aprova\u00e7\u00e3o e libera\u00e7\u00e3o de recursos<\/h2>\n\n\n\n

O virologista Fernando Spilki, professor da Feevale, diz que o Brasil tem condi\u00e7\u00f5es de “recuperar o terreno perdido” nessa \u00e1rea daqui para frente, com a libera\u00e7\u00e3o de recursos para pesquisas relacionadas \u00e0 covid-19.<\/p>\n\n\n\n

Ele est\u00e1 \u00e0 frente da rede Corona-\u00f4mica BR MCTIC\/Finep, um grande projeto de sequenciamento do Sars-CoV-2 que come\u00e7ou a ser desenhado em fevereiro do ano passado e recebeu a primeira parte do financiamento \u2014 que vai chegar no total a cerca de R$ 10 milh\u00f5es \u2014 entre setembro e outubro.<\/p>\n\n\n\n

A demora para libera\u00e7\u00e3o de recursos, segundo ele, n\u00e3o \u00e9 exclusividade do momento atual, mas “a rotina do pesquisador brasileiro”.<\/p>\n\n\n\n

A rede conta no momento com 14 institui\u00e7\u00f5es associadas, com 30 bolsistas CNPQ e mais uma centena de pesquisadores. Um dos objetivos \u00e9 mapear as linhagens do coronav\u00edrus que est\u00e3o circulando em algumas regi\u00f5es do pa\u00eds e entender o significado pr\u00e1tico de algumas muta\u00e7\u00f5es.<\/p>\n\n\n\n

Comentando sobre o esfor\u00e7o dos cientistas do pa\u00eds na \u00e1rea de vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica do coronav\u00edrus, o virologista acrescenta que a nova variante que circula em Manaus foi detectada primeiro no Jap\u00e3o e n\u00e3o no Brasil “por uma quest\u00e3o de horas”.<\/p>\n\n\n\n

Ele se refere ao trabalho dos cientistas do Centro Brasil-Reino Unido de Descoberta, Diagn\u00f3stico, Gen\u00f4mica e Epidemiologia de Arbov\u00edrus (grupo Cadde), que publicaram dois dias depois da notifica\u00e7\u00e3o das autoridades japonesas um estudo preliminar em que detalhavam a variante<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

O grupo, que tamb\u00e9m tem se dedicado a acompanhar por meio da an\u00e1lise gen\u00e9tica a evolu\u00e7\u00e3o do coronav\u00edrus, \u00e9 coordenado pela imunologista Ester Sabino, pesquisadora do Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da USP, que tamb\u00e9m esteve \u00e0 frente do primeiro sequenciamento do genoma do Sars-CoV-2 realizado no pa\u00eds, em fevereiro de 2020.<\/p>\n\n\n\n

J\u00e1 o Jap\u00e3o n\u00e3o est\u00e1 entre os 10 pa\u00edses que mais t\u00eam feito sequenciamento<\/a> do genoma do v\u00edrus em propor\u00e7\u00e3o ao total de infectados, mas tem realizado uma pol\u00edtica de vigil\u00e2ncia epidemiol\u00f3gica ativa em seus aeroportos na tentativa de evitar um aumento explosivo no n\u00famero de casos da doen\u00e7a.<\/p>\n\n\n\n

A grande maioria dos aeroportos conta h\u00e1 meses com “esta\u00e7\u00f5es de quarentena”, para onde s\u00e3o enviados os viajantes com diagn\u00f3stico positivo para covid.<\/p>\n\n\n\n

O pa\u00eds realiza testes em massa nos turistas e residentes que chegam do exterior \u2014 da\u00ed a raz\u00e3o por que identificou com rapidez a variante que circula no Amazonas.<\/p>\n\n\n\n

O Brasil, por sua vez, n\u00e3o faz vigil\u00e2ncia epidemiol\u00f3gica ativa nos aeroportos. As medidas est\u00e3o mais r\u00edgidas desde o dia 31 de dezembro, quando o pa\u00eds passou a exigir dos passageiros de voos internacionais um comprovante de diagn\u00f3stico negativo da doen\u00e7a de at\u00e9 72 horas antes do embarque.<\/p>\n\n\n\n

Antes disso, contudo, havia protocolos para casos suspeitos, mas, como se sabe, uma grande quantidade de casos de covid-19 \u00e9 assintom\u00e1tica.<\/p>\n\n\n\n

O ‘padr\u00e3o ouro’ do Reino Unido<\/h2>\n\n\n\n

O Reino Unido realiza hoje o maior n\u00famero di\u00e1rio de sequenciamentos do genoma do coronav\u00edrus e tem uma estrutura \u00fanica, que conta com o trabalho direto de cerca de 400 pessoas.<\/p>\n\n\n\n

O diretor de estrat\u00e9gia da for\u00e7a-tarefa, batizada de Covid-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), Ewan Harrison, conta que a equipe vai muito al\u00e9m dos cientistas e envolve uma grande opera\u00e7\u00e3o log\u00edstica, em que caminh\u00f5es transportam diariamente amostras do v\u00edrus coletadas em todo o pa\u00eds para os 16 hubs de sequenciamento.<\/p>\n\n\n\n

A hist\u00f3ria come\u00e7ou em 4 de mar\u00e7o, diante da preocupa\u00e7\u00e3o entre especialistas em genomas de pat\u00f3genos com a r\u00e1pida expans\u00e3o da covid-19 no pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

Menos de duas semanas depois, ap\u00f3s dias seguidos de reuni\u00f5es, o grupo formalizou uma proposta e a apresentou ao governo e a organismos de fomento.<\/p>\n\n\n\n

Naquele momento, alguns cr\u00edticos ao projeto argumentavam que os coronav\u00edrus mutavam menos do que muitos outros, como o influenza e o HIV, e que o esfor\u00e7o, portanto, seria uma perda de tempo.<\/p>\n\n\n\n

Parte deles n\u00e3o imaginava, entretanto, que o v\u00edrus infectaria milh\u00f5es de pessoas, o que acabou abrindo portas para a ocorr\u00eancia de uma s\u00e9rie de muta\u00e7\u00f5es.<\/p>\n\n\n\n

“Quando o v\u00edrus se replica, quando faz uma c\u00f3pia de si mesmo (de seu material gen\u00e9tico), ele ocasionalmente comete erros”, explica o microbiologista Ewan Harrison, ligado \u00e0 Universidade de Cambridge e ao Covid-19 Genomics UK Consortium.<\/p>\n\n\n\n

“Quanto mais v\u00edrus circulando, maior a probabilidade de isso acontecer. Quanto mais longas as infec\u00e7\u00f5es, maiores as chances de o v\u00edrus desenvolver uma muta\u00e7\u00e3o.”<\/p>\n\n\n\n

Naquele momento, o cons\u00f3rcio obteve um financiamento de 20 milh\u00f5es de libras (cerca de R$ 147 milh\u00f5es) e acabou de ver aprovado um aporte adicional de 12 milh\u00f5es (R$ 88 milh\u00f5es), que ser\u00e1 usado em parte para expandir a capacidade de sequenciamentos por semana para 20 mil e, posteriormente, para 30 mil.<\/p>\n\n\n\n

“N\u00f3s nunca fizemos o sequenciamento gen\u00e9tico de um pat\u00f3geno nessa escala, em t\u00e3o curto per\u00edodo de tempo. O que temos visto \u00e9 a evolu\u00e7\u00e3o em a\u00e7\u00e3o”, acrescenta Harrison.<\/p>\n\n\n\n

“Isso s\u00f3 refor\u00e7a o fato de que precisamos manter o n\u00famero de casos sob controle, temos que manter as medidas para tentar conter o v\u00edrus \u2014 usar m\u00e1scaras, manter o distanciamento social, a higiene das m\u00e3os”, completa.<\/p>\n\n\n\n

No caso da variante identificada no pa\u00eds, o cientista conta que o cons\u00f3rcio foi notificado no in\u00edcio de dezembro sobre um aumento s\u00fabito de casos em Londres e no sudeste do Reino Unido. A partir da\u00ed, os pesquisadores foram buscar no banco de genomas amostras daquela regi\u00e3o para entender se havia algo diferente.<\/p>\n\n\n\n

Foi a\u00ed que descobriram a B117, que tem 24 muta\u00e7\u00f5es, 13 que afetam a esp\u00edcula, que est\u00e1 associada \u00e0 entrada do v\u00edrus na c\u00e9lula do hospedeiro. H\u00e1 indicativos de que as muta\u00e7\u00f5es tenham tornado essa cepa mais contagiosa, mas n\u00e3o h\u00e1 ind\u00edcios de que ela leve a quadros mais graves de covid-19.<\/p>\n\n\n\n

A variante de Manaus<\/h2>\n\n\n\n

A virologista italiana Marta Giovanetti, que desde 2016 realiza pesquisas no Brasil e tem se dedicado \u00e0 vigil\u00e2ncia gen\u00f4mica do Sars-CoV-2 aqui, ressalta que o modelo brit\u00e2nico \u00e9 um ponto fora da curva.<\/p>\n\n\n\n

Para ela, a resposta do Brasil foi mais interessante do que a de seu pa\u00eds, que s\u00f3 mais recentemente passou a sequenciar mais genomas e a “produzir mais conhecimento”.<\/p>\n\n\n\n

“A gente viu que as regi\u00f5es mais afetadas (na It\u00e1lia) geraram genomas na ordem de centenas. Isso n\u00e3o descreve a realidade do que aconteceu, n\u00e3o permite realizar algum tipo de infer\u00eancia”, afirma.<\/p>\n\n\n\n

“Isso foi um pouco diferente no Brasil \u2014 l\u00f3gico que poderia ser bem melhor”, completa.<\/p>\n\n\n\n

Assim como a variante identificada no Reino Unido e na \u00c1frica do Sul, a encontrada em Manaus apresentou muta\u00e7\u00f5es nos genes que codificam a esp\u00edcula, a prote\u00edna que permite a entrada do v\u00edrus nas c\u00e9lulas humanas \u2014 e que pode indicar um aumento na transmissibilidade do v\u00edrus.<\/p>\n\n\n\n

Os dados analisados indicam que ela surgiu entre novembro e dezembro, diz Naveca, do Instituto Le\u00f4nidas & Maria Deane (ILMD\/Fiocruz Amaz\u00f4nia). O pesquisador espera aumentar o n\u00famero de sequenciamentos para identificar se a nova linhagem est\u00e1 circulando em todo Estado e, em caso positivo, com qual frequ\u00eancia. Por enquanto, n\u00e3o h\u00e1 dados sobre a circula\u00e7\u00e3o da variante no restante do pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

Para Naveca, por mais que a evolu\u00e7\u00e3o do v\u00edrus seja esperada, a nova cepa encontrada no Reino Unido, na \u00c1frica do Sul e, agora, no Brasil chamam aten\u00e7\u00e3o.<\/p>\n\n\n\n

“Elas acumularam muitas muta\u00e7\u00f5es em pouco tempo, acima do que a gente estava vendo at\u00e9 o momento.”<\/p>\n\n\n\n

Ainda assim, as raz\u00f5es por tr\u00e1s da explos\u00e3o no n\u00famero de casos no Amazonas ainda precisam ser melhor estudadas, diz o pesquisador, j\u00e1 que a explica\u00e7\u00e3o pode ser multifatorial.<\/p>\n\n\n\n

Al\u00e9m da variante que pode ser mais contagiosa, a regi\u00e3o entrou em novembro na temporada de v\u00edrus respirat\u00f3rios, com o “inverno amaz\u00f4nico”, e ainda reduziu o distanciamento social no per\u00edodo de festas.<\/p>\n\n\n\n

Por isso, o cientista faz um apelo aos brasileiros para que sigam as recomenda\u00e7\u00f5es para tentar evitar a dissemina\u00e7\u00e3o do v\u00edrus no pa\u00eds.<\/p>\n\n\n\n

“O v\u00edrus mutante n\u00e3o atravessa a m\u00e1scara, n\u00e3o resiste \u00e0 lavagem das m\u00e3os com \u00e1gua e sab\u00e3o, ao uso de \u00e1lcool gel. A transmiss\u00e3o tamb\u00e9m \u00e9 evitada com o distanciamento social.”<\/p>\n\n\n\n

Fonte: BBC Brasil <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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